Scott, Stiles, Allison, Jackson e Lydia sono intrappolati nel liceo mentre l’Alpha gli sta dando la caccia. Scott si propone volontario per cercare un modo di risolvere la situazione mentre Lydia prepara delle bombe molotov da usare in caso di ultima difesa. Convinto che l’Alpha abbia ucciso Derek, Scott lo accusa di aver assassinato il bidello e Derek è costretto a nascondersi dalla polizia.