Raj e Howard vogliono capire come mai Sheldon ogni santo giorno, alle 2:45 del pomeriggio, scompaia per venti minuti in uno sgabuzzino nel sotterraneo del dipartimento di fisica alla Caltech. Leonard è invece geloso di Cole uno studente inglese che lavora ad un progetto per il college insieme a Penny: la ragazza si arrabbierà moltissimo con Leonard, e questo porterà ad una sorprendente rivelazione. Rivedremo infine Alex Jensen, che è ancora l’assistente di Sheldon e deciderà di provarci con Leonard.